Integrated labo in Life sciences II
BIO-204 / 3 credits
Teacher(s): Bezler Alexandra, Grisoni-Neupert Barbara
Language: French
Retrait: Il n'est pas autorisé de se retirer de cette matière après le délai d'inscription.
Remarque: Donné tous les 15 jours par groupe
Résumé
Les étudiants appliquent des techniques de base en biologie moléculaire pour cloner un cDNA d'intérêt dans un plasmide d'expression afin de produire la protéine correspondante dans des cellules de mammifères. Ils purifient la protéine recombinante et la caractérisent biochimiquement.
Contenu
Projet: Clonage d'un ADNc cible et expression de la protéine dans des cellules de mammifères
Théorie et pratique des techniques suivantes :
- Bonnes pratiques au laboratoire
- Cartographie de restriction
- Analyse de sequençage Sanger
- Culture de cellules de mammifères
- Transfection de cellules de mammifères
- Microscopie optique
- Quantification de proteines
- Electrophorèse de protéines sur gel de polyacrylamide avec SDS
- Western blot
- Purification par chromatographie d'affinité d'une potèine
- Essai d'activité enzymatique
- Cinétique enzymatique
Mots-clés
Culture de cellules de mammifères, expression et purification de protéine recombinant, essai enzymatique.
Compétences requises
Cours prérequis indicatifs
BIO-110 Bio-organic chemistry
BIOENG-110 Biologie générale
BIO-205 Cellular and molecular biology I
BIO-207 Cellular and molecular biology II (en parallel)
Concepts importants à maîtriser
Acquis de formation
A la fin de ce cours l'étudiant doit être capable de:
- Appliquer des techniques expérimentales de base en biologie cellulaire et en biochimie
- Expliquer le principe des methodes utilisées
- Manipuler des proteins et des cultures de cellules de mammifères
- Conduire une expérience
- Appliquer les règles de sécurité en laboratoire
- Utiliser des outils d'analyse d'image
- Analyser des fragments d'ADN par électrophorèse sur gel d'agarose
- Analyser des protéines par électrophorèse sur gel de polyacrylamide avec SDS
- Utiliser une courbe d'étalonnage
- Utiliser le microscope optique
- Interpréter des données expérimentales
- Concevoir une expérience avec des contrôles appropriés
- Choisir ou sélectionner des techniques expérimentales appropriées dans un contexte différent
Compétences transversales
- Utiliser une méthodologie de travail appropriée, organiser un/son travail.
- Evaluer sa propre performance dans le groupe, recevoir du feedback et y répondre de manière appropriée.
- Utiliser les outils informatiques courants ainsi que ceux spécifiques à leur discipline.
- Recueillir des données.
- Ecrire un rapport scientifique ou technique.
- Résumer un article ou un rapport technique.
Méthode d'enseignement
A l'exception des séances d'introduction et workshops ex cathedra, l'enseignement est donné par l'alternance hebdomadaire de travaux pratiques au laboratoire et de travail personnel (exercices, analyse de données, rédaction du cahier de labo et rapports).
Travail attendu
Lire et étudier des documents sur Moodle avant chaque session de travaux pratiques.
Organisation du travail au sein du groupe (partage des tâches).
Réalisation des expériences en suivant la procedure indiquée.
Application des règles de sécurité en laboratoire.
Résolution des exercices.
Analyse des données expérimentales.
Rédaction de cahier de laboratoire électronique et rapports.
Méthode d'évaluation
Contrôle continu (cours annuel avec BIO-203)
- Cahiers de laboratoire électronique
- Rapport
- Examen
Encadrement
Office hours | Non |
Assistants | Oui |
Forum électronique | Non |
Ressources
Service de cours virtuels (VDI)
Non
Bibliographie
- Alberts B. et al., (2022). Molecular Biology of the Cell. 7th Edition.
- Reece, Jane B., et al. (2020) Campbell Biology. 12th Edition.
- Pechenik J. A Short Guide to Writing about Biology (2020). 8th Edition.
Ressources en bibliothèque
- Molecular Cloning / Sambrook
- Molecular Biology of the Cell / Alberts
- Campbell Biology / Reece
- A Short Guide to Writing about Biology / Pechenik
Polycopiés
Manuel de cours et documents affichés sur Moodle
Liens Moodle
Préparation pour
Bachelor project in life sciences (BIOENG-390)
Lab immersions (BIO-501, BIO-503, BIO-504)
In the programs
- Semester: Spring
- Exam form: During the semester (summer session)
- Subject examined: Integrated labo in Life sciences I,II
- Practical work: 3 Hour(s) per week x 14 weeks
- Practical work: 3 Hour(s) per week x 14 weeks
- Practical work: 3 Hour(s) per week x 14 weeks
- Practical work: 3 Hour(s) per week x 14 weeks
Reference week
Mo | Tu | We | Th | Fr | |
8-9 | |||||
9-10 | |||||
10-11 | |||||
11-12 | |||||
12-13 | |||||
13-14 | |||||
14-15 | |||||
15-16 | |||||
16-17 | |||||
17-18 | |||||
18-19 | |||||
19-20 | |||||
20-21 | |||||
21-22 |
Légendes:
Lecture
Exercise, TP
Project, other